Симптомы: состояние трекера - unregistered torrent.
Такого торрента нет на трекере (по-русски говоря)

Но как же они становятся "мертвыми", если как минимум один сид на раздаче есть (в данном случае это я)? 
Да, должен добавить: раздачи изначально не мои.
Значит юзер, загрузивший этот торрент, удалил его. Или раздача попала под поглощение и была удалена Модератором.

Скрипт автоудаления торрентов не может ошибаться. Он выслеживает раздачи, которые без сидов около 3 месяцев, помещает в "будут удалены" и ждёт ещё 10 дней (в общей сложности 90 дней). Сид не появился - в мусорку. Ошибки быть не может. Всё остальное это дело рук кого-нибудь пользователя, о которых я писал выше